Xã có vị trí:

• Bắc giáp xã Phú Linh, xã Linh Hồ.
• Đông giáp xã Ngọc Minh, xã Bạch Ngọc.
• Nam giáp xã Bạch Ngọc, xã Trung Thành.
• Tây giáp thị trấn Việt Lâm, thị trấn Vị Xuyên.

Xã Ngọc Linh có diện tích 54,93 km2, dân số năm 2017 là 5.096 người,[1] mật độ dân số đạt 93 người/km².

Xã Ngọc Linh được chia thành các thôn bản: Khuổi Vài, Ngọc Hà, Ngọc Thượng, Lăng Mu, Năm Đăm, Cốc Thổ, Khuổi Khà, Tân Phong, Nà Qua, Tân Lập, Lũng Loét, Nậm Thanh, Nậm Dầu, Ngọc Quang, Nậm Nhùng, Đội 5.

Bao gồm 13 dân tộc.